Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SNHG20-205ENST00000568363 786 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.327e-20■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 SEC14L1-209ENST00000564509 806 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.367e-20■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 SNHG20-203ENST00000565256 1234 ntTSL 1 (best)12.39□□□□□ -0.437e-20■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 SEC14L1-211ENST00000569632 377 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.497e-20■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.547e-20■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 SEC14L1-208ENST00000564414 528 ntTSL 1 (best)5.83□□□□□ -1.487e-20■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 SEC14L1-210ENST00000568056 424 ntTSL 1 (best)4.67□□□□□ -1.667e-20■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.514e-8■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.162e-8■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 ATP5C1-210ENST00000493053 1096 ntTSL 515.77■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 ATP5C1-206ENST00000465936 292 ntTSL 315.48■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 ATP5C1-208ENST00000473809 530 ntTSL 24.55□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 ATP5C1-209ENST00000480528 460 ntTSL 24.55□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 PSPC1-204ENST00000492741 1709 ntTSL 220.78■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 PSPC1-203ENST00000471658 1647 ntTSL 1 (best)18.23■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 PSPC1-208ENST00000635562 422 ntTSL 33.35□□□□□ -1.875e-7■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 LRCH3-208ENST00000443727 611 ntTSL 420.18■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 UBE3C-203ENST00000430750 448 ntTSL 411.58□□□□□ -0.561e-12■■■■■ 35.8
TARDBPQ13148 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.062e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.042e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-207ENST00000455712 823 ntTSL 312.75□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-210ENST00000476003 648 ntTSL 211.71□□□□□ -0.532e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-205ENST00000443489 807 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.532e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-211ENST00000488213 1035 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-202ENST00000429568 878 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-212ENST00000489043 433 ntTSL 210.29□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 POLR2H-206ENST00000452961 791 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 CD53-204ENST00000476408 756 ntTSL 56.69□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 CD53-205ENST00000497404 917 ntTSL 54.87□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.991e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.961e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 220.71■□□□□ 0.911e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.71e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 412.48□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 412.07□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.883e-6■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 35.7
TARDBPQ13148 LINC01748-201ENST00000439156 1798 ntTSL 511.92□□□□□ -0.57e-9■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 LINC01748-205ENST00000635616 2143 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.187e-9■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.527e-9■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.397e-8■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.647e-8■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.787e-8■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.167e-8■■■■■ 35.6
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TARDBPQ13148 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-67■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 ZNF280A-201ENST00000302097 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 35.6
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TARDBPQ13148 ZEB2-217ENST00000470879 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.881e-26■■■■■ 35.5
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TARDBPQ13148 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.681e-10■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.691e-10■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.812e-10■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 AK2-206ENST00000480134 811 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-10■■■■■ 35.5
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TARDBPQ13148 HERC1-202ENST00000558324 828 ntTSL 512.02□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 35.5
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TARDBPQ13148 RSL24D1-206ENST00000569386 442 ntTSL 310.43□□□□□ -0.746e-10■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 RSL24D1-202ENST00000562895 435 ntTSL 310.26□□□□□ -0.776e-10■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 HERC1-212ENST00000561348 588 ntTSL 210.02□□□□□ -0.816e-10■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 RSL24D1-201ENST00000260443 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.896e-10■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 RSL24D1-203ENST00000562993 940 ntTSL 37.46□□□□□ -1.226e-10■■■■■ 35.5
TARDBPQ13148 PNCK-218ENST00000462280 704 ntTSL 320.71■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 29.44□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-208ENST00000457837 998 ntTSL 522.61■■□□□ 1.213e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-217ENST00000494086 1075 ntTSL 319.78■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-213ENST00000482371 943 ntTSL 319.12■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-205ENST00000436699 1059 ntTSL 28.92□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-206ENST00000442065 812 ntTSL 36.12□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-216ENST00000491150 885 ntTSL 35.32□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.713e-7■■■■■ 35.4
TARDBPQ13148 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.114e-54■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.114e-54■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.084e-54■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.57e-9■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 KMT2C-205ENST00000418673 682 ntTSL 511.16□□□□□ -0.624e-8■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.417e-7■■■■■ 35.3
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