Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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