Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 21.93□□□□□ -2.15e-8■■■■■ 46.9
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SF3A3Q12874 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 46.8
SF3A3Q12874 GYS1-205ENST00000484289 459 ntTSL 39.39□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 46.7
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SF3A3Q12874 EXOSC10-205ENST00000470611 401 ntTSL 36.41□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 46.7
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SF3A3Q12874 DENND5A-203ENST00000525784 782 ntTSL 39.4□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 46.6
SF3A3Q12874 DENND5A-206ENST00000527700 3593 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 46.6
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SF3A3Q12874 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 46.6
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SF3A3Q12874 TMEM94-207ENST00000578624 583 ntTSL 410.81□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 46.3
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SF3A3Q12874 CDK18-210ENST00000484080 1040 ntTSL 213.53□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 46.2
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SF3A3Q12874 CDK18-223ENST00000515514 541 ntTSL 410.49□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 46.2
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SF3A3Q12874 CARD8-209ENST00000518979 3533 ntTSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 46.2
SF3A3Q12874 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 46.2
SF3A3Q12874 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 46.2
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SF3A3Q12874 DDX42-205ENST00000577978 581 ntTSL 53.6□□□□□ -1.836e-40■■■■■ 46.1
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SF3A3Q12874 WDR13-204ENST00000470124 437 ntTSL 313.63□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 45.7
SF3A3Q12874 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 45.7
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SF3A3Q12874 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.554e-8■■■■■ 45.5
SF3A3Q12874 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 45.5
SF3A3Q12874 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.184e-10■■■■■ 45.5
SF3A3Q12874 REV1-203ENST00000413697 4727 ntTSL 220.99■□□□□ 0.954e-10■■■■■ 45.5
SF3A3Q12874 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.094e-10■■■■■ 45.5
SF3A3Q12874 REV1-212ENST00000482595 484 ntTSL 52.8□□□□□ -1.964e-10■■■■■ 45.5
SF3A3Q12874 PDLIM7-207ENST00000486828 1904 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 45.3
SF3A3Q12874 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 45.3
SF3A3Q12874 PDLIM7-208ENST00000493815 1686 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 45.3
SF3A3Q12874 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 45.3
SF3A3Q12874 KHSRP-209ENST00000597704 706 ntTSL 514.05□□□□□ -0.166e-9■■■■■ 45.2
SF3A3Q12874 DBNL-215ENST00000458579 662 ntTSL 317.22■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 45
SF3A3Q12874 DBNL-202ENST00000423561 634 ntTSL 213.08□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 45
SF3A3Q12874 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.45□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 45
SF3A3Q12874 RPL22-206ENST00000480661 2279 ntTSL 1 (best)21.17■□□□□ 0.981e-15■■■■■ 45
SF3A3Q12874 RPL22-204ENST00000465387 508 ntTSL 219.36■□□□□ 0.691e-15■■■■■ 45
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SF3A3Q12874 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-15■■■■■ 45
SF3A3Q12874 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.181e-15■■■■■ 45
SF3A3Q12874 RPL22-202ENST00000462296 600 ntTSL 37.49□□□□□ -1.211e-15■■■■■ 45
SF3A3Q12874 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 24.54□□□□□ -1.681e-15■■■■■ 45
SF3A3Q12874 TKFC-219ENST00000534084 964 ntTSL 312.32□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 44.9
SF3A3Q12874 TMEM94-208ENST00000578853 905 ntTSL 312.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 44.9
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