Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBRQ0VD83 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms