Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMOD3Q0VAK6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMOD3Q0VAK6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD3Q0VAK6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMOD3Q0VAK6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMOD3Q0VAK6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMOD3Q0VAK6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMOD3Q0VAK6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMOD3Q0VAK6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMOD3Q0VAK6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMOD3Q0VAK6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms