Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPAL4Q0D2K0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms