Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCBP1Q09161 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms