Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RBL2Q08999 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms