Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXM1Q08050 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms