Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN3Q08043 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms