Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRP1Q07954 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRP1Q07954 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms