Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC3A1Q07837 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC3A1Q07837 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms