Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP4Q07065 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKAP4Q07065 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms