Protein–RNA interactions for Protein: Q06336

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, yeastyeast

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GGA1Q06336 YHR182WYHR182W 2358 nt5.77□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 AFT1YGL071W 2073 nt5.76□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 DIA3YDL024C 1407 nt5.76□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 TUL1YKL034W 2277 nt5.76□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 TUP1YCR084C 2142 nt5.76□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 RPS2YGL123W 765 nt5.76□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 AIM20YIL158W 615 nt5.76□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YEH1YLL012W 1722 nt5.76□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 GUA1YMR217W 1578 nt5.76□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 AVO1YOL078W 3531 nt5.75□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YDR015CYDR015C 240 nt5.75□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 RPT6YGL048C 1218 nt5.75□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 DJP1YIR004W 1299 nt5.75□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YMR122CYMR122C 375 nt5.75□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YMR252CYMR252C 405 nt5.75□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YPL062WYPL062W 405 nt5.75□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 FRE3YOR381W 2136 nt5.74□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 TFG2YGR005C 1203 nt5.74□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 ECT1YGR007W 972 nt5.74□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.74□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 PRS1YKL181W 1284 nt5.74□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YIL067CYIL067C 2037 nt5.74□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 ICL1YER065C 1674 nt5.73□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 RME1YGR044C 903 nt5.73□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 TDH2YJR009C 999 nt5.73□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 PFA3YNL326C 1011 nt5.73□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 RAD24YER173W 1980 nt5.73□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 GIT1YCR098C 1557 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 ASF2YDL197C 1578 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 VNX1YNL321W 2727 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 HSF1YGL073W 2502 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 IDP1YDL066W 1287 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 VCX1YDL128W 1236 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YFR035CYFR035C 345 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 CAX4YGR036C 720 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 YBL112CYBL112C 318 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 ATP1YBL099W 1638 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 UTP18YJL069C 1785 nt5.72□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 BPL1YDL141W 2073 nt5.71□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 CDC1YDR182W 1476 nt5.71□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 KCH1YJR054W 1494 nt5.71□□□□□ -1.49
GGA1Q06336 SEC18YBR080C 2277 nt5.71□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SNF3YDL194W 2655 nt5.71□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 HVG1YER039C 750 nt5.71□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 NOC4YPR144C 1659 nt5.7□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YDL057WYDL057W 987 nt5.7□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SCS22YBL091C-A 528 nt5.7□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 PAB1YER165W 1734 nt5.7□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 PXA1YPL147W 2613 nt5.7□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 TOS3YGL179C 1683 nt5.69□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YDL218WYDL218W 954 nt5.69□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.69□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.69□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.69□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 CIN4YMR138W 576 nt5.69□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SNZ2YNL333W 897 nt5.69□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SEG2YKL105C 3399 nt5.68□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SEC9YGR009C 1956 nt5.68□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 ATH1YPR026W 3636 nt5.68□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YER084WYER084W 387 nt5.68□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.68□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.68□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SIP2YGL208W 1248 nt5.67□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 MSP1YGR028W 1089 nt5.67□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 KSS1YGR040W 1107 nt5.67□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 MED6YHR058C 888 nt5.67□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 STM1YLR150W 822 nt5.67□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YLR317WYLR317W 435 nt5.67□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 PDE1YGL248W 1110 nt5.66□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 SFC1YJR095W 969 nt5.66□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 JNM1YMR294W 1122 nt5.66□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YMR295CYMR295C 594 nt5.66□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YNL285WYNL285W 372 nt5.66□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 ENT2YLR206W 1842 nt5.65□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 LYS12YIL094C 1116 nt5.65□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 YOR111WYOR111W 699 nt5.65□□□□□ -1.5
GGA1Q06336 APE3YBR286W 1614 nt5.65□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.65□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 RFA1YAR007C 1866 nt5.64□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 RPR2YIR015W 435 nt5.64□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 SPG4YMR107W 348 nt5.64□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 GFD1YMR255W 567 nt5.64□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 SIA1YOR137C 1869 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 YDL129WYDL129W 876 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 RPS5YJR123W 678 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 HLJ1YMR161W 675 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 NUD1YOR373W 2556 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 GRS1YBR121C 2004 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 ADE6YGR061C 4077 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 YMR027WYMR027W 1413 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 VMA13YPR036W 1437 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 YTA6YPL074W 2265 nt5.63□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 YDR109CYDR109C 2148 nt5.62□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 HIR1YBL008W 2523 nt5.62□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 SEC20YDR498C 1152 nt5.62□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 MDH1YKL085W 1005 nt5.62□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 YKL107WYKL107W 930 nt5.62□□□□□ -1.51
GGA1Q06336 RBD2YPL246C 789 nt5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.8 ms