Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP1Q04837 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms