Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A11Q02978 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A11Q02978 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms