Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX6A2Q02221 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6A2Q02221 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms