Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB1Q01826 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms