Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS1Q01581 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS1Q01581 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS1Q01581 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS1Q01581 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGCS1Q01581 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGCS1Q01581 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGCS1Q01581 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGCS1Q01581 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms