Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A2Q01362 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A2Q01362 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms