Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDLBPQ00341 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms