Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX3P78415 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX3P78415 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX3P78415 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX3P78415 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX3P78415 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX3P78415 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX3P78415 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX3P78415 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX3P78415 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX3P78415 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX3P78415 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX3P78415 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX3P78415 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX3P78415 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX3P78415 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX3P78415 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX3P78415 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX3P78415 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX3P78415 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRX3P78415 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRX3P78415 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX3P78415 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX3P78415 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX3P78415 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX3P78415 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX3P78415 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX3P78415 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX3P78415 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX3P78415 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX3P78415 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX3P78415 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX3P78415 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX3P78415 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX3P78415 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX3P78415 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX3P78415 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX3P78415 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX3P78415 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX3P78415 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX3P78415 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX3P78415 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX3P78415 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX3P78415 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX3P78415 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX3P78415 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX3P78415 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX3P78415 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX3P78415 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX3P78415 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX3P78415 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX3P78415 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX3P78415 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX3P78415 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX3P78415 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX3P78415 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX3P78415 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX3P78415 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms