Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPNP63162 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms