Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms