Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRA2BP62995 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRA2BP62995 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms