Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSNL1P62760 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSNL1P62760 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms