Protein–RNA interactions for Protein: P62495

ETF1, Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETF1P62495 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETF1P62495 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETF1P62495 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETF1P62495 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETF1P62495 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETF1P62495 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETF1P62495 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETF1P62495 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETF1P62495 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETF1P62495 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETF1P62495 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETF1P62495 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETF1P62495 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETF1P62495 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ETF1P62495 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ETF1P62495 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ETF1P62495 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ETF1P62495 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ETF1P62495 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ETF1P62495 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETF1P62495 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETF1P62495 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETF1P62495 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETF1P62495 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETF1P62495 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETF1P62495 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ETF1P62495 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ETF1P62495 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ETF1P62495 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ETF1P62495 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ETF1P62495 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETF1P62495 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETF1P62495 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETF1P62495 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETF1P62495 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETF1P62495 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETF1P62495 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETF1P62495 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETF1P62495 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETF1P62495 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETF1P62495 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETF1P62495 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETF1P62495 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETF1P62495 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETF1P62495 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETF1P62495 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ETF1P62495 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ETF1P62495 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETF1P62495 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETF1P62495 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETF1P62495 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETF1P62495 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETF1P62495 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ETF1P62495 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETF1P62495 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms