Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms