Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF3P61204 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF3P61204 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF3P61204 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF3P61204 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF3P61204 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF3P61204 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF3P61204 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF3P61204 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF3P61204 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF3P61204 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF3P61204 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF3P61204 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF3P61204 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF3P61204 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF3P61204 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF3P61204 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF3P61204 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF3P61204 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF3P61204 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF3P61204 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF3P61204 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF3P61204 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF3P61204 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF3P61204 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF3P61204 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF3P61204 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF3P61204 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF3P61204 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF3P61204 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF3P61204 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF3P61204 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF3P61204 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF3P61204 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF3P61204 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF3P61204 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF3P61204 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF3P61204 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF3P61204 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF3P61204 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF3P61204 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF3P61204 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF3P61204 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF3P61204 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF3P61204 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF3P61204 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF3P61204 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF3P61204 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF3P61204 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF3P61204 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF3P61204 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF3P61204 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF3P61204 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF3P61204 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF3P61204 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF3P61204 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF3P61204 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF3P61204 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF3P61204 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF3P61204 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF3P61204 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF3P61204 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF3P61204 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF3P61204 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF3P61204 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF3P61204 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF3P61204 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms