Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN1P60606 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms