Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A3P57103 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms