Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTCP1P56278 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
MTCP1P56278 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms