Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP1P56182 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP1P56182 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP1P56182 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP1P56182 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP1P56182 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP1P56182 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP1P56182 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP1P56182 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP1P56182 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP1P56182 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP1P56182 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP1P56182 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP1P56182 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP1P56182 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP1P56182 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP1P56182 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP1P56182 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP1P56182 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP1P56182 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP1P56182 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRP1P56182 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRP1P56182 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRP1P56182 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRP1P56182 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP1P56182 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP1P56182 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP1P56182 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP1P56182 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP1P56182 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP1P56182 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP1P56182 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP1P56182 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP1P56182 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP1P56182 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP1P56182 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP1P56182 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP1P56182 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP1P56182 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP1P56182 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP1P56182 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP1P56182 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP1P56182 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP1P56182 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP1P56182 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP1P56182 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP1P56182 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP1P56182 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP1P56182 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP1P56182 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RRP1P56182 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP1P56182 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP1P56182 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP1P56182 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP1P56182 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP1P56182 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP1P56182 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP1P56182 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP1P56182 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP1P56182 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP1P56182 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP1P56182 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP1P56182 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP1P56182 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP1P56182 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP1P56182 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP1P56182 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP1P56182 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP1P56182 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP1P56182 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP1P56182 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP1P56182 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP1P56182 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP1P56182 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP1P56182 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP1P56182 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP1P56182 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP1P56182 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP1P56182 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP1P56182 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP1P56182 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP1P56182 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
RRP1P56182 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
RRP1P56182 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP1P56182 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP1P56182 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP1P56182 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP1P56182 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP1P56182 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP1P56182 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP1P56182 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP1P56182 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms