Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP9P55211 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP9P55211 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP9P55211 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP9P55211 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP9P55211 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP9P55211 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP9P55211 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP9P55211 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP9P55211 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP9P55211 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP9P55211 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP9P55211 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP9P55211 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP9P55211 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP9P55211 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP9P55211 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP9P55211 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP9P55211 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP9P55211 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP9P55211 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP9P55211 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP9P55211 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP9P55211 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP9P55211 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP9P55211 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP9P55211 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP9P55211 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP9P55211 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP9P55211 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP9P55211 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP9P55211 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP9P55211 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP9P55211 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP9P55211 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP9P55211 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP9P55211 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP9P55211 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP9P55211 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP9P55211 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP9P55211 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP9P55211 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP9P55211 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP9P55211 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP9P55211 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP9P55211 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP9P55211 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP9P55211 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP9P55211 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP9P55211 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP9P55211 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms