Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCKAP1LP55160 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCKAP1LP55160 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms