Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1H2P55055 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms