Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB3P54753 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms