Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RARSP54136 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RARSP54136 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RARSP54136 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RARSP54136 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RARSP54136 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RARSP54136 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RARSP54136 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RARSP54136 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RARSP54136 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RARSP54136 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RARSP54136 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RARSP54136 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RARSP54136 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RARSP54136 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RARSP54136 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RARSP54136 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RARSP54136 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RARSP54136 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RARSP54136 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RARSP54136 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RARSP54136 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RARSP54136 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RARSP54136 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RARSP54136 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RARSP54136 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RARSP54136 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RARSP54136 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RARSP54136 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RARSP54136 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RARSP54136 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RARSP54136 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RARSP54136 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RARSP54136 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RARSP54136 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RARSP54136 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RARSP54136 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RARSP54136 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RARSP54136 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RARSP54136 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RARSP54136 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RARSP54136 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RARSP54136 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RARSP54136 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RARSP54136 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RARSP54136 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RARSP54136 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RARSP54136 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RARSP54136 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RARSP54136 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RARSP54136 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RARSP54136 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARSP54136 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RARSP54136 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RARSP54136 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RARSP54136 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RARSP54136 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RARSP54136 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RARSP54136 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARSP54136 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARSP54136 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARSP54136 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARSP54136 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARSP54136 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARSP54136 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARSP54136 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARSP54136 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARSP54136 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms