Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA8P53708 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms