Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2E1P51965 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms