Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSHP51688 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSHP51688 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSHP51688 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSHP51688 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSHP51688 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSHP51688 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSHP51688 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSHP51688 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSHP51688 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGSHP51688 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGSHP51688 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSHP51688 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSHP51688 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSHP51688 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSHP51688 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSHP51688 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSHP51688 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSHP51688 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSHP51688 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSHP51688 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSHP51688 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSHP51688 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSHP51688 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSHP51688 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSHP51688 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSHP51688 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSHP51688 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSHP51688 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSHP51688 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSHP51688 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSHP51688 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSHP51688 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSHP51688 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSHP51688 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSHP51688 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSHP51688 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSHP51688 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSHP51688 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSHP51688 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSHP51688 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSHP51688 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSHP51688 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSHP51688 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSHP51688 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSHP51688 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSHP51688 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSHP51688 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSHP51688 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSHP51688 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSHP51688 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSHP51688 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSHP51688 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSHP51688 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSHP51688 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSHP51688 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSHP51688 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSHP51688 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSHP51688 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSHP51688 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSHP51688 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSHP51688 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSHP51688 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGSHP51688 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGSHP51688 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGSHP51688 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms