Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR5P51681 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR5P51681 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR5P51681 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR5P51681 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR5P51681 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR5P51681 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR5P51681 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR5P51681 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR5P51681 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR5P51681 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR5P51681 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR5P51681 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR5P51681 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR5P51681 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR5P51681 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR5P51681 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR5P51681 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR5P51681 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR5P51681 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR5P51681 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR5P51681 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR5P51681 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR5P51681 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR5P51681 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR5P51681 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR5P51681 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR5P51681 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR5P51681 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR5P51681 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR5P51681 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR5P51681 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR5P51681 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR5P51681 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR5P51681 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR5P51681 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR5P51681 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR5P51681 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR5P51681 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR5P51681 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR5P51681 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR5P51681 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR5P51681 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR5P51681 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR5P51681 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR5P51681 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR5P51681 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR5P51681 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR5P51681 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR5P51681 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR5P51681 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR5P51681 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR5P51681 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR5P51681 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR5P51681 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR5P51681 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR5P51681 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR5P51681 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR5P51681 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR5P51681 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR5P51681 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR5P51681 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR5P51681 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR5P51681 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR5P51681 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR5P51681 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR5P51681 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR5P51681 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR5P51681 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms