Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D1P51668 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms