Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE6CP51160 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms