Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATMP50440 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATMP50440 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATMP50440 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATMP50440 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATMP50440 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATMP50440 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATMP50440 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATMP50440 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATMP50440 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATMP50440 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATMP50440 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATMP50440 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATMP50440 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATMP50440 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GATMP50440 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATMP50440 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATMP50440 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATMP50440 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATMP50440 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GATMP50440 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GATMP50440 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATMP50440 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATMP50440 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATMP50440 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATMP50440 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATMP50440 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATMP50440 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATMP50440 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATMP50440 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATMP50440 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATMP50440 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATMP50440 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATMP50440 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATMP50440 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATMP50440 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATMP50440 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATMP50440 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GATMP50440 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATMP50440 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATMP50440 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATMP50440 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATMP50440 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATMP50440 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATMP50440 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATMP50440 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATMP50440 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GATMP50440 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATMP50440 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATMP50440 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATMP50440 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATMP50440 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATMP50440 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATMP50440 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATMP50440 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATMP50440 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATMP50440 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GATMP50440 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GATMP50440 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GATMP50440 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GATMP50440 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GATMP50440 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GATMP50440 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GATMP50440 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GATMP50440 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GATMP50440 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GATMP50440 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GATMP50440 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATMP50440 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATMP50440 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATMP50440 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GATMP50440 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATMP50440 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATMP50440 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms