Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLK1P49759 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK1P49759 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK1P49759 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLK1P49759 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLK1P49759 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLK1P49759 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLK1P49759 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLK1P49759 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLK1P49759 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLK1P49759 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLK1P49759 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLK1P49759 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK1P49759 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK1P49759 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK1P49759 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK1P49759 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK1P49759 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK1P49759 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK1P49759 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK1P49759 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK1P49759 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK1P49759 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK1P49759 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK1P49759 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK1P49759 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK1P49759 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLK1P49759 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLK1P49759 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLK1P49759 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLK1P49759 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLK1P49759 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLK1P49759 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK1P49759 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK1P49759 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK1P49759 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK1P49759 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK1P49759 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms