Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRIM2P49643 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms