Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARS2P49590 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARS2P49590 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARS2P49590 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARS2P49590 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARS2P49590 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARS2P49590 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARS2P49590 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARS2P49590 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARS2P49590 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HARS2P49590 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HARS2P49590 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HARS2P49590 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HARS2P49590 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HARS2P49590 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HARS2P49590 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARS2P49590 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARS2P49590 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARS2P49590 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARS2P49590 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARS2P49590 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARS2P49590 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARS2P49590 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARS2P49590 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARS2P49590 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HARS2P49590 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARS2P49590 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARS2P49590 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HARS2P49590 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARS2P49590 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARS2P49590 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARS2P49590 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARS2P49590 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARS2P49590 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HARS2P49590 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARS2P49590 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARS2P49590 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARS2P49590 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HARS2P49590 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARS2P49590 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARS2P49590 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARS2P49590 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARS2P49590 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARS2P49590 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARS2P49590 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARS2P49590 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARS2P49590 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARS2P49590 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HARS2P49590 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARS2P49590 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARS2P49590 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARS2P49590 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARS2P49590 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARS2P49590 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARS2P49590 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARS2P49590 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARS2P49590 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HARS2P49590 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARS2P49590 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARS2P49590 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARS2P49590 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARS2P49590 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARS2P49590 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARS2P49590 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARS2P49590 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARS2P49590 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARS2P49590 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARS2P49590 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARS2P49590 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARS2P49590 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARS2P49590 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARS2P49590 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARS2P49590 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms