Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MARCKSL1P49006 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSL1P49006 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms