Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMUP48645 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMUP48645 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMUP48645 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMUP48645 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMUP48645 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMUP48645 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMUP48645 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMUP48645 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMUP48645 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMUP48645 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMUP48645 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMUP48645 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMUP48645 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMUP48645 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMUP48645 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMUP48645 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMUP48645 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMUP48645 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMUP48645 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMUP48645 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMUP48645 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMUP48645 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMUP48645 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMUP48645 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMUP48645 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMUP48645 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMUP48645 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMUP48645 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMUP48645 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMUP48645 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMUP48645 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMUP48645 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMUP48645 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMUP48645 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMUP48645 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMUP48645 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMUP48645 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMUP48645 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMUP48645 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMUP48645 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMUP48645 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMUP48645 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms